Στον Κανονισμό Εσωτερικής Λειτουργίας (Κ.Ε.Λ.) του Φ.Α.Α.Ε.Δ. καθορίζονται και εξειδικεύονται οι διαδικασίες που αφορούν στην ωρίμανση και αξιοποίηση ακινήτων, οι διαδικασίες οικονομικής διαχείρισης, προϋπολογισμού, απολογισμού και περιουσίας του Φ.Α.Α.Ε.Δ., θέματα υγείας και ασφάλειας στην εργασία, προστασίας προσωπικών δεδομένων, εταιρικής διακυβέρνησης, επαγγελματικής δεοντολογίας, πολιτικές κατά της βίας και της παρενόχλησης στην εργασία, επιμέρους θέματα προστασίας της εμπιστευτικότητας και του απορρήτου των πληροφοριών και κάθε άλλη αναγκαία λεπτομέρεια για την εσωτερική λειτουργία του Φ.Α.Α.Ε.Δ..