Το ΚΕΤΕΑΘ είναι το πιο πρόσφατο ΕΚ και το οποίο αποτελεί, μαζί με το Πανεπιστήμιο και το ΤΕΙ Θεσσαλίας, τον επιστημονικό και τεχνολογικό πυρήνα για την ανάπτυξη της Περιφέρειας Θεσσαλίας. Έχει ως αποστολή την διεξαγωγή βασικής και εφαρμοσμένης έρευνας σε τομείς που αντιστοιχούν στους βασικούς οικονομικούς άξονες της Θεσσαλίας, δηλαδή τη γεωργία, τη βιομηχανία, τις υπηρεσίες υγείας, το ευ ζην και την εκπαίδευση, ενώ η διάρθρωσή του περιλαμβάνει τέσσερα παραρτήματα-ινστιτούτα που εδρεύουν στις τέσσερις πρωτεύουσες των Νομών της Θεσσαλίας.
Σήμερα, το ΚΕΤΕΑΘ περιλαμβάνει τέσσερα (4) Ινστιτούτα, ως ακολούθως:
[1]
Στο πλαίσιο της αντιμετώπισης του φαινομένου του κατακερματισμού και πολυδιάσπασης των ερευνητικών πεδίων και της επίτευξης κρίσιμης μάζας σε βασικούς ερευνητικούς τομείς και λόγω της περιορισμένης ερευνητικής δραστηριότητας των ινστιτούτων του ΚΕΤΕΑΘ που απορρέει από τα λίγα χρόνια λειτουργίας του κέντρου και το περιορισμένο σε πλήθος ερευνητικό δυναμικό, προτείνονται οι εξής παρεμβάσεις αναδιάρθρωσης:
- η συγχώνευση των 4 ινστιτούτων του ΚΕΤΕΑΘ σε ένα πολυτομεακό Ινστιτούτο Έρευνας & Τεχνολογίας Θεσσαλίας με έδρα τη Θεσσαλία (Λάρισα)
- η κατάργηση του ΚΕΤΕΑΘ και η διοικητική υπαγωγή του συγχωνευμένου Ινστιτούτου Έρευνας & Τεχνολογίας Θεσσαλίας στο ΕΚΕΤΑ
Ως προς την παραπάνω πρόταση αναδιάρθρωσης του ΚΕΤΕΑΘ εξετάζεται η ακόλουθη εναλλακτική πρόταση:
- Απορρόφηση των ερευνητικών δραστηριοτήτων των ινστιτούτων του ΚΕΤΕΑΘ από το ΕΚΕΤΑ (χωρίς τη δημιουργία αυτόνομου ινστιτούτου με έδρα τη Λάρισα)