Το ΙΤΕ αποτελεί ένα ιδιαίτερα επιτυχημένο πολυθεματικό ερευνητικό κέντρο, το οποίο έχει επιτύχει υψηλής ποιότητας επιστημονική και τεχνολογική Έρευνα, διεθνή προβολή της χώρας, διεθνείς συνεργασίες, στήριξη της πανεπιστημιακής εκπαίδευσης, σύνδεση με την παραγωγή, συμβολή στην περιφερική ανάπτυξη, κοινωφελές έργο και σημαντική εν γένει προσφορά στην τοπική και εθνική οικονομία. Επιπλέον, τα ινστιτούτα του ΙΤΕ λειτουργούν, εκτός από το Ηράκλειο, στο Ρέθυμνο, την Πάτρα και τα Ιωάννινα προσδίδοντας έντονα διαπεριφερειακό χαρακτήρα στη δράση του ενώ παράλληλα το Κέντρο έχει αναπτύξει επιτυχώς και πρόσθετες δραστηριότητες, όπως το δίκτυο ΠΡΑΞΗ και τις Πανεπιστημιακές Εκδόσεις Κρήτης.
Σήμερα, το ΙΤΕ περιλαμβάνει επτά (7) Ινστιτούτα, ως ακολούθως:
[1]
Με δεδομένο τον πολυθεματικό χαρακτήρα του ΙΤΕ, στο πλαίσιο της αντιμετώπισης του φαινομένου
του κατακερματισμού και πολυδιάσπασης των ερευνητικών πεδίων και της επίτευξης κρίσιμης μάζας σε βασικούς ερευνητικούς τομείς, προτείνονται οι εξής παρεμβάσεις αναδιάρθρωσης:
- η συγχώνευση του ΙΒΕ και του ΙΜΒΒ λόγω συνάφειας των ερευνητικών πεδίων και της συγκέντρωσης κρίσιμης μάζας στον τομέα των βιοεπιστημών με διατήρηση της παρουσίας στο Ηράκλειο και τα
Ιωάννινα - τη διατήρηση των λοιπών ινστιτούτων ως έχουν λόγω εξειδικευμένων ερευνητικών πεδίων και ύπαρξης κρίσιμης μάζας στα αντικείμενα αυτά
Με βάση τα ανωτέρω, η πρόταση αναδιάρθρωσης του ΙΤΕ περιλαμβάνει έξι (6) ινστιτούτα
ως εξής:
[2]
Ως προς την παραπάνω πρόταση αναδιάρθρωσης του ΙΤΕ εξετάζεται η ακόλουθη εναλλακτική πρόταση:
- Διαφοροποίηση από την υφιστάμενη κατάσταση με την επιλογή της συγχώνευσης του Ινστιτούτου Βιοϊατρικών Ερευνών (ΙΒΕ) με το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων