Οι αποφάσεις των Περιφερειακών Συνελεύσεων του Σ.Α.Ε. λαμβάνονται με απλή πλειοψηφία των μελών που συμμετέχουν είτε με φυσική παρουσία είτε ηλεκτρονικά. Οι Περιφερειακές Συνελεύσεις του Σ.Α.Ε. καταρτίζουν τον Κανονισμό Λειτουργίας τους. Στους Κανονισμούς προβλέπονται οι κανόνες λειτουργίας τους και ο τρόπος διοργάνωσης των εκλογών.
Έκτακτη Περιφερειακή Συνέλευση δύναται να συγκληθεί μετά από αίτημα της πλειοψηφίας των τριών τετάρτων (3/4) των μελών του Συντονιστικού Συμβουλίου της αντίστοιχης Περιφέρειας ή του ενός έκτου (1/6) του συνόλου των μελών της Περιφερειακής Συνέλευσης.