1. Ο Οργανισμός του Ινστιτούτου εγκρίνεται από την Εποπτική Επιτροπή μετά από σχετική εισήγηση του Προέδρου του Ινστιτούτου. Ο Οργανισμός κυρώνεται και τίθεται σε ισχύ με προεδρικό διάταγμα που εκδίδεται με πρόταση του Υπουργού Εξωτερικών. Η ίδια διαδικασία ακολουθείται και για την τροποποίηση του Οργανισμού.
2. Ο Οργανισμός ρυθμίζει και εξειδικεύει τα θέματα που αφορούν στην εσωτερική οργάνωση και τη λειτουργία του Ινστιτούτου και ιδίως:
α) τους εν γένει σκοπούς, καθώς και την εκπλήρωση των επιστημονικών και εκπαιδευτικών σκοπών του Ινστιτούτου,
β) τη διάρθρωση των υπηρεσιών του Ινστιτούτου,
γ) τις επιμέρους αρμοδιότητες της Εποπτικής Επιτροπής, των οργάνων διοίκησης και του προσωπικού,
δ) τα προσόντα, τα δικαιώματα, τα καθήκοντα και τον πειθαρχικό έλεγχο του προσωπικού καθώς και
ε) τον προϋπολογισμό, τον απολογισμό και την εν γένει διαχείριση των οικονομικών του Ινστιτούτου.