- Το Δ.Σ. συνεδριάζει στην έδρα της Υ.Π.Α. με φυσική παρουσία ή με τηλεδιάσκεψη, κατόπιν έγγραφης πρόσκλησης του Προέδρου του. Στην πρόσκληση ορίζονται η ημέρα, η ώρα, καθώς και τα θέματα της ημερήσιας διάταξης. Οι συνεδριάσεις διενεργούνται τακτικά, τουλάχιστον μια (1) φορά τον μήνα, και εκτάκτως, αν προκύψουν θέματα προς συζήτηση. Η έκτακτη σύγκληση του Δ.Σ. είναι υποχρεωτική, εφόσον τη ζητήσουν τρία (3) τουλάχιστον μέλη του Δ.Σ. ή ένας εκ των Υποδιοικητών της Υ.Π.Α. για θέματα αρμοδιότητάς του, με αίτηση που υποβάλλεται στον Πρόεδρο του Δ.Σ.
- Χρέη εισηγητή στο Δ.Σ. εκτελεί ο Πρόεδρος του Δ.Σ., ο οποίος δύναται να ορίζει ως εισηγητή Γενικό Διευθυντή ή Διευθυντή από τις οργανικές μονάδες της Υ.Π.Α.
- Στις συνεδριάσεις του Δ.Σ. δύναται να παρίστανται, κατόπιν πρόσκλησης και χωρίς δικαίωμα ψήφου, οι Γενικοί Διευθυντές, οι Διευθυντές και οι νομικοί σύμβουλοι της Υ.Π.Α., καθώς και κάθε άλλο πρόσωπο του οποίου η παρουσία κρίνεται απαραίτητη σε σχέση με τα θέματα συζήτησης της συνεδρίασης αυτής.
- Ο Πρόεδρος του Δ.Σ. κηρύσσει την έναρξη και τη λήξη των συνεδριάσεων, διευθύνει τις εργασίες, προεδρεύει των συνεδριάσεων, μεριμνά για την εύρυθμη λειτουργία του Δ.Σ. και ασκεί κάθε άλλη αρμοδιότητα που του ανατίθεται με απόφαση του Δ.Σ.
- Για τις συζητήσεις και τις αποφάσεις του Δ.Σ. τηρούνται πρακτικά που καταχωρίζονται σε ειδικό βιβλίο. Τα πρακτικά υπογράφονται από τον Πρόεδρο του Δ.Σ., τα μέλη και τον γραμματέα του. Στα πρακτικά καταχωρίζονται και οι γνώμες της μειοψηφίας.
- Αντίγραφα ή αποσπάσματα των πρακτικών υπογράφονται από τον Πρόεδρο του Δ.Σ. και τον γραμματέα του και χορηγούνται από τον τελευταίο, κατόπιν απόφασης του Δ.Σ., μετά από σχετική αίτηση του ενδιαφερομένου.
- Οι αποφάσεις του Δ.Σ. λαμβάνονται με την απόλυτη πλειοψηφία των παρόντων μελών του και με φανερή ψηφοφορία. Σε περίπτωση ισοψηφίας, υπερισχύει η ψήφος του Προέδρου του Δ.Σ. Οι αποφάσεις του Δ.Σ. δημοσιεύονται, όταν αυτό προβλέπεται ειδικώς, με πράξη του Προέδρου του στην Εφημερίδα της Κυβερνήσεως, αναρτώνται στην ιστοσελίδα της Υ.Π.Α. και κοινοποιούνται στον Υπουργό Υποδομών και Μεταφορών και στους ενδιαφερόμενους φορείς.